教师姓名:万瑛(兼职导师)
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       万瑛教授,博士生导师,任重庆市细胞组学重点实验室主任。近年取得主要成就包括:一、首次绘制出树突状细胞内Rab介导囊泡运输的组织框架图,揭示细胞内存在防御胞内细菌感染的新型膜性结构。作为天然免疫和获得性免疫的桥梁,树突状细胞完成抗原的摄取、处理和递呈过程,在此吞噬体为核心的连续囊泡转运过程中涉及复杂分子调控机制,其中大量Rab蛋白家族成员局限性定位在各种内吞囊泡的膜表面,精密调节内吞囊泡的定向转运,在内吞膜性结构移动中执行着中心调动功能。为阐明Rab调控树突状细胞吞噬囊泡转运机制,我们构建了一个构建高效捕获相互作用蛋白复合物的串联亲和纯化新技术,发现373个Rab相互作用蛋白和649个蛋白相互作用对,作为高可信数据存储在国际蛋白质相互作用数据库(IntAct),绘制了树突状细胞内Rab介导囊泡运输的组织框架图。在研究树突状细胞加工处理胞内细菌抗原(李斯特菌)的过程中,我们发现溶酶体相关细胞器不仅招募到吞噬体,而且隔离从吞噬体逃逸到胞浆的李斯特菌,揭示溶酶体相关细胞器构成针对吞噬体(“第一波”防御)逃逸胞内细菌的“第二波”新型膜性防御机制,我们将其命名为“胞内吞噬体(intracellular phagosome)途径”。根据Rab GTPas蛋白质相互作用网络提供的线索,发现溶酶体相关细胞器发生相关的Rab32-Rab38子网络参与限制李斯特菌胞内复制,并证实其中的Rab32-PHB-PHB2蛋白复合体控制李斯特菌包裹囊泡的酸化过程,相关研究数据发表在Immunity, 2016, 44: 422-37。 二、国内率先建立T细胞组库研究技术,发现初始型T细胞趋同选择维持外周免疫耐受机制。效应T细胞存活维持是特异性T细胞应答终末环节,这些存活的效应T细胞重塑获得性免疫系统,影响免疫耐受和免疫防御功能。我们在在国内率先采用深度测序分析T细胞免疫组库,开展系统免疫学研究。优化人和小鼠T细胞受体多重PCR扩增引物,建立数据分析流程,在此基础开发数据分析软件。围绕胃癌T细胞免疫库测序分析工作,发现胃癌远端粘膜T细胞多样性指数与病人远期生存预后有关(Oncoimmunology, 2015; 4:e1001230);跟踪药物超敏反应病人的T细胞免疫组库动态变化,发现T细胞免疫组库波动大的病人病情严重(Scientific Rep. 2015; 5:9913)。为了研究健康状态下初始型(Naïve)T细胞遭遇自身抗原后的演变规律,我们和杜克大学庄原教授合作构建TCRδ-Cre-ER基因敲入小鼠,通过脉冲标记幼年小鼠胸腺释放的初始型T细胞,发现从胸腺迁徙至外周组织的绝大多数示踪初始T细胞寿命较短,但一部分记忆型和调节性T细胞表型T细胞生存下来成为长寿命T细胞克隆,揭示生理状态下初始T细胞存活存在异质性。通过T细胞库深度测序技术发现不同小鼠长期存活调节性T细胞克隆间具有大量相似的TCR序列。这些研究结果揭示健康状态下胸腺输出的部分初始T细胞遭遇自身抗原经历免疫应答,并且在自身抗原趋同选择下,效应细胞转变成长期存活的调节性T细胞,参与维持外周免疫免疫耐受,从而为外周免疫免疫耐受形成提供了理论模型。相关研究数据发表在Proc Natl Acad Sci USA. 2016, 113: 9858–9863。三、结合细胞组学需求,基于六轴机械臂联合研发智能生物实验机器人。